协和医院贺永文贺教授介绍说，目前乙肝治疗尚没有特效药，所能达到的最好效果就是抑制病毒的复制，但不能清除病毒。
肝功能不正常DNA阳性治疗最佳时机
一般来说，乙肝病毒携带者只要转氨酶正常，就不需要抗病毒治疗，但要每3～6个月定期复查肝功能，否则还会对肝肾功能造成进一步损害。一旦查出肝功能不正常并DNA呈阳性，即说明肝炎病毒正在大量复制，肝细胞被大量破坏，此时就是抗病毒治疗的最佳时机。
抗病毒干扰素和拉米夫定公认有效
目前，抗乙肝病毒药物主要有干扰素、核酐类（拉米夫定）、免疫调节剂（如胸腺肽）以及中医中药，但公认有效的只有干扰素和拉米夫定，其他药效尚不明确。
但干扰素和拉米夫定也各有其优缺点和严格的适应症，必须经正规医院肝病专科治疗。如干扰素需要注射使用不方便且副作用较大，肝硬化和重症肝炎患者一般不能使用；拉米夫定起效快，口服方便，副作用较小，但需长期服药，病毒变异几率和抗药性相对较高，短时间服用容易复发。
贺教授指出，这两种药物只是把病毒暂时压下来，一旦耐药性升高就容易复发；另外病毒也会“适者生存”而发生变异。不过，停药后变异株会消失。他强调说，任何药物都不排除引起病情加重，但从临床上看，这两种药发生率很低。
抗病毒治疗并非人人有效
上述药物并非万能钥匙，而只能抑制病毒的复制，且只对大部分患者有效，比如拉米夫定，只有60％～70％的患者有效。
因此，医生为病人选定药物后要进行3～6个月的观察，无效则要重新选药，初步取得疗效则要在医生指导下坚持用药，比如干扰素一般使用半年到一年，拉米夫定一般使用一年到二年，除非出现不良反应，不能擅自停药。
联合用药尚在探索阶段
因为拉米夫定具有诱导病毒突变的作用，因此临床医生正在探索通过“联合用药”的方法来治疗乙肝，比如与拉米夫定搭配用干扰素，但这样做的效果尚不明确，还处在实验阶段。