神经性头疼的试验室检查一般不会有问题，本身属于功能性疾病，大脑的检查如颅脑CT、磁共振、脑电图、脑彩超、脑脊液等都是正常的。大多数病人脑彩超检查会有脑供血不足的现象，但这些是短暂性或可逆性的，是由于头颈部肌肉痉挛压迫血管造成的一过性现象。
神经性头疼病史比较长的病人脑部检查不是不可以的，做个脑部CT检查也是必须的，可以排除脑瘤或其他器质性病变，多次重复检查不仅花费大量资金，造成病人经济负担，而且会对人体造成放射性伤害。
神经性头痛检查不是完全没有问题的，通过细致的心理分析会发现多数病人存在心理问题，如抑郁症状、焦虑症状、人际关系障碍、强迫症状或疑病观念等，只要找到导致头痛的神经心理因素，加以心理治疗或心理指导，结合神经肌肉放松训练或综合的放松措施和综合的物理治疗，神经性头痛的治疗不是没有希望的。