许多疾病可以合并尿路结石，主要有：
（1）甲状旁腺功能亢进 甲状旁腺腺瘤、增生等疾病都可以使甲状旁腺分泌增加，导致骨骼脱钙，还可以增加肠道对钙的吸收，进而使血钙、尿钙升高。这是含钙结石形成的重要原因。
（2）外伤性截瘫 由于截瘫或外伤等原因长期卧床引起骨骼脱钙，可以发生高钙尿。另一方面，由于神经源性膀胱功能障碍也容易形成结石，尤其是在合并泌尿系感染时。
（3）尿路的梗阻性疾病 尿路任何部位的梗阻都可以导致结石的形成。较为常见的有前列腺增生症、尿道狭窄、输尿管狭窄、肾盂输尿管交界处梗阻等。尿路手术后再次发生的狭窄也可成为结石发生或复发的原因。
（4）痛风 约10%的痛风病人会因血、尿中尿酸水平增高而合并尿酸结石。
（5）各种伴有骨骼脱钙的疾病 如多发性骨髓瘤、溶骨性多发性骨癌等都可引起高钙尿。
（6）皮质醇症 由于皮质醇类固醇激素的分泌量增加，使骨钙析出并使肾脏排钙增加。
（7）肠源性高草酸尿 小肠大部切除后出现的“短肠结合症”、慢性消化不良等疾病亦可造成草酸吸收过多，导致高草酸尿，形成草酸钙结石。
（8）维生素D中毒 维生素D能提高肠道内钙的吸收，故长期服用维生素D可发生高血钙和高尿钙，有利于尿石形成。此外，恶性肿瘤、白血病、牛皮癣等疾病可导致尿中尿酸排泄增加；维生素B6缺乏可引起高草酸尿；这些都可成为结石形成的条件。